Foundation!? Nutze ich selten. Keine Erfahrung. Nimm doch mal ein Theme von Will. Da gibt es auch ein kostenloses Blank Theme. Der Code von Will scheint mir immer sehr ordentlich und sauber zu sein.
WebYep habe ich auch in beiden Versionen installiert. Die Stacks meine ich. Das sollte kein Problem sein. Natürlich nur nicht gleichzeitig verwenden
Anderer Versuch: Interne Serverfehler bei CMS haben oft was zu tun mit Rechteproblemen der ausführbaren Dateien des CMS. Welche Rechte haben denn die für das CMS verantwortlichen Dateien bzw. Verzeichnisse?
Konsequenterweise würde ich dann lieber gleich einen Test mit dem RapidWeaver SDK Theme machen